Das Projekt
Forschungsfrage
- Hierzu wird zunächst untersucht, ob es Unterschiede in der Zusammensetzung und Häufigkeit von Bakterien der Mund- und Darmflora zwischen gesunden und an Vorhofflimmern erkrankten Personen gibt.
- Weiterhin wird die zeitliche Änderung der bakteriellen Flora in Abhängigkeit des Krankheitsverlaufs nach 12 Monaten analysiert.
- Die sich ergebenden Unterschiede werden in einem speziellen Patientenkollektiv mit Änderungen des Immunsystems in Verbindung gebracht.
Experimenteller Ansatz
Zur Beantwortung unserer Forschungsfrage bedienen wir uns der sog. Next Generation Sequencing Technik – einer der modernsten und genausten Verfahren zur Bestimmung der bakteriellen Zusammensetzung einer Probe. Nach der Abgabe einer Speichel- und Stuhlprobe mit Hilfe spezieller Kits, welche die Inaktivierung der enthaltenen Bakterien bewirken und gleichzeitig die bakterielle Erbsubstanz vor dem Abbau schützen, erfolgt eine mehrschrittige Analyse:
Probenaufbereitung
Zunächst werden die Proben speziell aufbereitet und die bakterielle Erbsubstanz gezielt isoliert, gereinigt und mittels Polymerase-Kettenreaktion (PCR) vervielfältigt.
Sequenzierung
Die isolierte bakterielle Erbsubstanz wird mit Hilfe modernster Methoden sequenziert, d. h. der genetische Code entschlüsselt.
Cloud-basierte Analyse
Der ermittelte genetische Code wird durch einen Abgleich mit einer Cloud-basierten Datenbank nun in die dazugehörige Bakterienspezies übersetzt. Darüberhinaus gelingt auch die Bestimmung der Anzahl der entsprechenden Bakterienspezies.
WIR
Unser Studienteam
PD. Dr. Volker Ruppert
Dr. Muhidien Soufi
Prof. Dr. Sabine Pankuweit
Hr. Lek Babalija
Janna-Nele Wilkens
Ekaterina Fabricius
Daniela Beppler
Katharina Hoyer-Weiß
Heike Eckhardt
Studienteilnahme
Wurde Ihr Interesse geweckt? Unterstützen Sie das Projekt mit Ihrer Studienteilnahme und erfahren Sie mehr über Ihre steten bakteriellen Begleiter.
Hört Ihr Herz auf Ihren Bauch?
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Philipps-Universität Marburg – Der Präsident
Biegenstraße 10, D-35037 Marburg
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